生物柴油设备在进行油液的制备工艺中，这其中也包含了醋酸的精馏过程，在这过程中温度的控制是很关键的，因此设备中还要配备相应的冷却器。由于醋酸在酸溜过程中会产生一些污染物，有可能会污染冷却器，因此需要对应的给生物柴油设备进行维护。

       要对冷却器进行保养的话，先要使其停运。一般都是先停热流后停冷流。然后按照按照扫线规程扫净管壳程内介质，并等到醋酸精馏塔温度下降至许可温度后才能进一步操作。这过程中，要在停冷却水的同时打开冷却水放空阀，以免损坏设备。

       为了不影响冷却效果，冷却器投用时应打开冷却线上放空阀排气，并且在见水后关闭。大部分冷却器都是以入口控制作为控制水量的方式，这虽然可以节约冷水，但是会造成冷却器内水流短路或流速减慢而影响换热效果，所以可以改变生物柴油设备的控制方式。